En el corazón izquierdo hipoplásico, el flujo sanguíneo al cuerpo está severamente afectado.  Después del nacimiento, un bebé con el síndrome del corazón izquierdo hipoplásico estará enfermo y con un color pobre.  En algunos casos en donde se mantiene abierto el conducto arterioso (persistencia del conducto arterioso, PDA en el diagrama a la izquierda), puede haber pocos síntomas inicialmente.

Sin embargo, cuando se cierra el conducto arterioso (PCA), el infante entrara en profundo shock.  Sin tratamiento, muere en pocas semanas de haber nacido.